課程資訊
課程名稱
生物晶片操作與資料分析
Microarray Experiment and Data Analysis 
開課學期
100-2 
授課對象
生物資源暨農學院  生物科技研究所  
授課教師
蔡孟勳 
課號
Biot5006 
課程識別碼
642EU0080 
班次
 
學分
全/半年
半年 
必/選修
選修 
上課時間
星期四5,6,7(12:20~15:10) 
上課地點
生技所415 
備註
本課程以英語授課。
限學士班三年級以上
總人數上限:10人
外系人數限制:9人 
Ceiba 課程網頁
http://ceiba.ntu.edu.tw/1002microarray 
課程簡介影片
 
核心能力關聯
核心能力與課程規劃關聯圖
課程大綱
為確保您我的權利,請尊重智慧財產權及不得非法影印
課程概述

Introduction of microarray and data analysis
Generation of Targets for spotted microarray
Sample plate design for spotted microarray
Printing design of microarray chip
Post-processing for microarray chip
Introduction of cell culture and RNA sample extraction
RNA purification and RNA quality check
Microarray hybridization
Microarray image scanning
Gal file preparation
Introduction of databases for microarray data analysis
 

課程目標
This course will introduce basic concepts and techniques of “Microarray experiment and data analysis”. This course also provides the hand-on experiments for students to learn how to make microarray chips, microarray hybridization and microarray data analysis. Students will learn the hand-on skills of microarray related technology and gain a great vision on current trends of investigations in this field to lead their own research. 
課程要求
 
預期每週課後學習時數
 
Office Hours
 
指定閱讀
 
參考書目


 
評量方式
(僅供參考)
 
No.
項目
百分比
說明
1. 
出席及課堂表現  
10% 
 
2. 
實驗報告 
50% 
 
3. 
期末考 
40% 
 
 
課程進度
週次
日期
單元主題
第1週
2/23  Overview
 
第2週
3/01  Inoculate, miniprep and DNA gel electrophoresis

 
第3週
3/08  Introduction of PCR and spectrophotometer

 
第4週
3/15  出國開會 
第5週
3/22  Plate transfer-Beckman FX introduction

 
第6週
3/29  Printing design (OmniGrid arrayer) (基因體中心7F)
 
第7週
4/05  溫書假 
第8週
4/12  Post-processing 
第9週
4/19  期中考 
第10週
4/26  Cell culture and RNA extraction
 
第11週
5/03  RNA purification and RNA quality check 
第13週
5/19  cDNA labelling, and Array Hybridization 
第14週
5/24  Gal file preparation and image scan 
第14週
5/20  Array Hybridization 
第15週
5/31  Microarray data analysis 
第16週
6/07  停課一次 
第17週
6/14  Illumina and Affymetrix array system 
第18週
6/21  Final Exam